Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms