Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pnmal2G3X9N3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnmal2G3X9N3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms