Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim55G3X8Y1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim55G3X8Y1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms