Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp9yF8VPU6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp9yF8VPU6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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