Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Farp1F8VPU2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms