Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M1F7CXU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms