Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syngap1F6SEU4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms