Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm340F6RGI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm340F6RGI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm340F6RGI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm340F6RGI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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