Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Herc6F2Z461 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Herc6F2Z461 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Herc6F2Z461 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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