Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
6030445D17RikE9Q8F9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms