Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20518E9Q548 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20518E9Q548 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20518E9Q548 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20518E9Q548 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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