Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Y8

Gm6811, Predicted gene 6811, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6811E9Q3Y8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm6811E9Q3Y8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6811E9Q3Y8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms