Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdzd2E9Q1M1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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