Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp558E9Q1J0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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