Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms