Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fndc1E9Q043 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms