Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd1E9PZ26 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms