Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph10bE9PYQ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms