Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms