Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc17E9PVB5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms