Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3bE9PUL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms