Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms