Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1110002E22RikE0CYV9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1110002E22RikE0CYV9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms