Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms