Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3543D3Z235 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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