Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms