Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms