Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsig10D3YX43 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms