Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nxpe3B9EKK6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms