Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20547B8JJN0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20547B8JJN0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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