Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms