Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms