Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clrn2B2RVW2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clrn2B2RVW2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms