Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rrn3B2RS91 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms