Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf518aB2RRF6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms