Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf518bB2RRE4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms