Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms