Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms