Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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