Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms