Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syndig1A2ANU3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syndig1A2ANU3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms