Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GabreA2AMW3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GabreA2AMW3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms