Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam43bA2AM80 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms