Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SetxA2AKX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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