Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd1A2AKB4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd1A2AKB4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd1A2AKB4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms