Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms