Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a3A2ACT7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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