Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprfA2A8L5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms