Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms