Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3550W4VSN7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3550W4VSN7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms